La Secretaría de Salud del estado se encuentra en vías de transición en la prestación de los servicios médicos al organismo público descentralizado (OPD) IMSS-Bienestar, donde el personal, infraestructura, equipamiento, medicamentos y demás insumos asociados ya serán injerencia de este nuevo organismo.
Actualmente los servicios médicos se encuentran bajo responsabilidad del OPD IMSS-Bienestar con 446 centros de salud, 30 centros de salud con servicios ampliados, 14 centros de salud con hospitalización, ocho clínicas para la Atención de Parto Humanizado y una Clínica de la Mujer.
Con esta federalización se garantiza el derecho a la salud de todas y todos los chiapanecos.